Die letzten Kilometer des Wachaumarathons verlaufen über die B3, Zellerplatz, Steiner Donaulände, Karl-Eybl-Gasse, Steiner Landstraße, Undstraße, Schillerstraße, Josef-Wichner-Straße- Südtirolerplatz, Utzstraße, Ringstraße, Gartenaugasse, Göglstraße, Dr.-Pollhammer-Gasse, Eisentürgasse, Mondlgasse, Eyblparkstraße und zurück über die Ringstraße. Die Stadtdurchfahrt ist aus diesem Grund zwischen 9 Uhr und ca. 16 Uhr gesperrt. Autofahrer können großräumig über die Donaubrücken auf das rechte Donauufer ausweichen.
Trotz Straßensperren sind einzelne Punkte in der Innenstadt über Umleitungen erreichbar: Stadteinwärts von Mauterner Brücke über die Steiner Donaulände, Dr.-Karl-Dorrekstraße, Alauntalstraße, Stadtgraben oder Stöhrgasse, Pfarrplatz - Südtirolerplatz über Stöhrgasse, Schmelzgasse, Körnermarkt, Schmidgasse erreichbar. Die Einbahnführung in der Alauntalstraße zwischen Gaswerkgasse und Stadtgraben wird in Richtung stadteinwärts geändert.
Stadtauswärts Richtung Westen (Mauterner Brücke) ausgehend vom Pfarrplatz über Stöhrgasse oder Schlüsselamtsgasse, Schmelzgasse oder Doninikanerplatz, Körnermarkt, Schmidgasse, Südtirolerplatz, Kasernstraße, Gaswerkgasse, Alauntalstraße Richtung Westen, Dr.-Karl-Dorrek-Straße, Zellerplatz, Steiner Donaulände erreichbar.
Stadtauswärts Richtung Osten ausgehend vom Pfarrplatz ist über die Wegscheid, Untere Landstraße möglich. Krankenhaus, Badearena und Stadtpark sind von Osten kommend über Austraße bzw. Bertschingerstraße erreichbar. Der Bahnhof ist für Anrainer und Taxis von der Wachaubrücke über einen Fahrstreifen in der Ringstraße erreichbar.